1.R统计绘-RDA分析、Mantel检验及绘
2.asr翱捷什么时候上市？
3.Apache Traffic Server简介

R统计绘-RDA分析、Mantel检验及绘

       1 基本信息

       ANOSIM、PERMANOVA和MRPP三种群落结构分析方法都是基于分类变量进行的分析，而基于连续变量的群落结构分析使用Mantel检验和variation partition analysis(envfit()函数)。envfit()在 R绘图-RDA排序分析中已经讲过了，账号之家源码这里就只讲Mantel。Mantel分析其实之前也在 R统计-微生物群落结构差异分析及结果解读一文中讲过了，文中还包括偏mantel分析，需要的同学可以去看看。约束性排序分析(RDA或CCA)分析经常都是与mantel检验一起进行，检验环境因子变量与群落结构变化的相关性。之前的推文写的有点复杂、分散，正好最近还需要分析一批数据，安装界面源码再写一份RDA + mantel检验的教程。

       Mantel()函数用于对两个相异矩阵进行相关性分析，如分别对微生物组成数据和环境因子(C、N、P含量等)计算距离矩阵，然后进行环境因子变化与微生物群落结构间的相关性(或解释度)，可以根据数据情况选择使用pearson、spearman或 kendall相关性指数。

       2 分析流程

       2.1 设置工作路径并调用R包

       2.2 数据准备

       数据包括1个物种组成丰度表，1个基因丰度表以及1个环境因子表。将环境因子数据分别与物种丰度和基因丰度数据进行RDA和mantel分析。

       2.3 RDA分析及绘图

       约束性排序其实包括线性模型和单峰模型，具体分类在 R统计-PCA/PCoA/db-RDA/NMDS/CA/CCA/DCA等排序分析教程一文中有详细介绍。RDA属于线性模型，自动补全源码CCA是单峰模型。因此在进行约束性排序分析之前，需要先对数据进行检测，判断应该选择那种模型。怎样选择模型在 R绘图-RDA排序分析写过，大家可以去看。

       注：分析输出结果都详细介绍，在R统计-PCA/PCoA/db-RDA/NMDS/CA/CCA/DCA等排序分析教程一文中有写，这里不再赘述。

       2.4 mantel分析及可视化

       Science上发表过一幅很漂亮的mantel可视化图，图中还包括环境因子相关性，是使用ggcor画的。但该包作者已经把这个包删除了。不过我在网上搜索发现github上还有人保存的千图+源码有源码。可以直接安装。但是受我的生物统计老师影响，我的原则是能把原始数据展示出来，就一定要展示出来。所以这里就不重现这幅图了。

       绘制气泡图，并添加r值标签，同时显示基因、物种丰度与环境因子的mantel分析结果。

       这里只是一个简单的RDA、mantel分析绘图流程，其中时间还有很多需要注意的细节，对环境因子的筛选步骤也省略了。如果想更深入的木鱼+网站源码了解排序分析，可以看一下数量生态学以及在网上搜索其他资料。

asr翱捷什么时候上市？

       大概在6月日的时候，翱捷科技已经在科创板挂牌。说到ASR这个名字，我在这里就不得不提到老板戴老板了，因为他可以说也是一个半导体界的名门望族，美国芯片巨头Marvell和国内芯片设计服务龙头芯片最初由戴氏家族兄弟姐妹创立，戴老板早年创立锐迪科，在美国正式上市，那个时候，2G网络时代，还是非常流行的。

       而且在那个时候，很多大佬的风头比现在要大得多了，但是，他无奈输给了强行收购的“资本狂人”赵老板，从哪以后，他在私有化后退出了RDA，并带着他公司的所有兄弟创建了一个全新的ASR，据说这个名字是对 SPREADTRUM & RDA 的缩写，取名字的时候不忘展讯和锐迪科，可见他对赵老板的恨意有多深。

       但是无论如何，戴老板在圈里的地位还在，随着一声崛起，各路金主纷纷涌向他，不过话虽如此，在场上地位高的人还是比较多的，真正让傲捷赚到钱的，其实是收购了Marvell的移动部门，只用了3.6亿，就获得了多人和一个完整的基带IP，据说他们搬到了这里，Marvell服务器还自带N多源代码，真是白菜价。

       按照目前这家芯片公司的估值，这个团队和IP要人均1亿，一个百亿就够了，直接让翱捷有了出货和购买芯片的基础，其次，他在另外2次收购里，不得不说是有点麻烦，不是个人气候的问题，不过，我实在不敢对ASR的上市抱有太高的期望，即使与国内较好的增长预期相比，利润较好的半导体上市公司也会给出倍的市销率，而翱捷则是多亿市值。 

Apache Traffic Server简介

       Apache Traffic Server，通常简称ATS或TS，是一个功能强大的HTTP代理和缓存服务器。它与Nginx和Squid一样，被设计为提供高效的网络服务。最初由Inktomi公司开发，这家公司后来被Yahoo收购。在年，Yahoo将Traffic Server的源代码捐赠给了Apache软件基金会，并在年，它正式成为ASF的顶级项目，标志着其开源身份的确立。Traffic Server的主要编程语言是C++。

       Chuck Neerdaels，Traffic Server的早期开发负责人之一，同时也是Harvest项目的创始人，Harvest项目后来演变成广受欢迎的Squid。Leif Hedstrom接过了Traffic Server的开发领导大旗，尽管Neerdaels和Hedstrom现在分别加入了CDN服务提供商Akamai，但他们对Traffic Server的贡献仍然深远影响着该项目的发展。

       作为开源项目，Apache Traffic Server不断吸引着全球开发者们的贡献，为用户提供更快、更可靠的网络服务。它的核心价值在于其模块化设计和高度的性能优化，使其在现代互联网环境中扮演着重要的角色。